II. 真菌鉴定

准确鉴定真菌分离物对环境监测计划至关重要。对真菌核糖体 DNA ITS2 区进行比较测序,此类基因型方法被业界公认为最准确且可重现的未知微生物鉴定方法,因为该技术具有固有的稳定性。

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真菌鉴定服务: AccuGENX-ID® FunITS 

长期以来,真菌鉴定,特别是丝状真菌,一直是一项难度很大的工作。由于精确鉴定丝状真菌到种水平需要丰富的经验和大量时间,通常的做法是将这些生物鉴定到属的水平,或者在某些情况下,简单地将其鉴定为“霉菌”。

Charles River AccuGENX-ID® FunITS 通过对真菌内部转录间隔区(ITS2)区域进行比较测序来鉴定真菌分离物。 ITS2区是通常被测序的真菌DNA区,被真菌分类学家广泛接受为“金标准”。 由于ITS区域在紧密相关物种之间的变异程度要高于其他DNA区域(例如D2),因此ITS无疑是鉴定真菌到种水平的现有最佳方法。

AccuGENX-ID®鉴定报告指南

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本真菌鉴定服务的遗传方法是比其他任何真菌鉴定检测方法更可靠、更快速的鉴定微生物到种的方法。 这种经过科学验证的方法结合经验证的、持续有效的专有真菌数据库,可实现更准确的真菌鉴定。 将真菌鉴定外包给我们符合cGMP要求,ISO 17025认证的合约检测实验室,可以节省时间和资源,让您专注于其他重要的QC任务。

用于真菌鉴定的基因分析方法

AccuGENX-ID® FunITS 真菌鉴定服务使用基因型分析过程,该过程遵循分类学家使用的参考对照方法,因为它为真菌鉴定提供了最准确,最可靠的序列数据。 提交真菌鉴定服务申请且样品送达我们的实验室后,我们的团队将使用基因分析仪对其进行处理,评估真菌DNA序列的质量,进行匹配,然后在经验证的Accugenix®数据库中进行比较。

          Webinar: 使用系统发生方法的微生物鉴定 

您是否会对测序鉴定报告上最匹配的微生物进行进一步的探究,如果没有这样做,您可能会错失与结果相关的有价值的内容

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系统树由受过训练的数据分析人员解读,以便进行真菌鉴定。 基因型分析,加上覆盖范围全面的经验证的数据库,可提供无可匹敌的真菌系统发育分析。

我们的微生物系统学家在解释细菌鉴定报告和分配生物分类置信度时综合利用了遗传变异性,邻近连接树的分支顺序以及种间变异的知识。

Charles River 的真菌鉴定服务所采用的专有方法将样品序列与全面的专有数据库进行比较,得出结论性的数据解释,并根据系统发育分析确定具有指定置信度的鉴定。

 

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AccuGENX-ID®真菌(ITS2) 2天   FunITS-2
5天   FunITS-5

AccuGENX-ID® 鉴定报告指

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